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杀入三代测序蓝海 地贫产品能成为贝瑞基因新的业绩增长点吗?

作者:崔笑天

来源:华夏时报

发布时间:2021-08-28 16:50:24

摘要:贝瑞基因董事长高扬告诉《华夏时报》记者,三代测序与二代测序并非互相取代的关系,在临床市场上,它更多呈现相对互补的状态。“三代测序可以解决很多二代测序做不到的问题,比如一些结构特殊、位置特殊的基因突变,这是很多基因病的成因,而二代测序解决的更多的是染色体病。”

杀入三代测序蓝海 地贫产品能成为贝瑞基因新的业绩增长点吗?

华夏时报(www.chinatimes.net.cn)记者 崔笑天 北京报道

继无创产筛之后,贝瑞基因又成为三代测序领域的“破局者”。

8月24日,贝瑞基因宣布了公司推出三代测序产品——三代地贫,即运用第三代基因测序技术进行地中海贫血携带者筛查。

目前,二代测序是分子诊断领域的主流技术,三代测序尚未大规模临床应用,仅有少数公司进行布局。相比二代测序,其在读长上具有优势,但传统观念认为存在错误率高、成本高等问题。

而这次三代地贫产品的问世,是贝瑞基因在三代测序领域的一次试水,在产品的不断验证的过程中,三代测序的种种局限也在得到解决。贝瑞基因董事长高扬告诉《华夏时报》记者,三代测序与二代测序并非互相取代的关系,在临床市场上,它更多呈现相对互补的状态。“三代测序可以解决很多二代测序做不到的问题,比如一些结构特殊、位置特殊的基因突变,这是很多基因病的成因,而二代测序解决的更多的是染色体病。”

这也意味着,未来三代测序有望向更多应用场景拓展,比如其他罕见病、肿瘤、辅助生殖等。

而聚焦本次的三代地贫产品,或将成为贝瑞基因短期内新的业绩增长点。中国南方是地贫的高发地区,一直以来地贫预防主要由政府主导推动。由于三代地贫产品价格相对传统检测仅高出20%,且准确度、覆盖面有全面提升,贝瑞基因有望在部分省市与政府达成合作。未来,借助其在无创产筛业务的渠道、资源积累,地贫产品有望快速打开市场,实现放量增长。

三代测序破冰

目前,主流三代测序平台分为两大类:一是PacBio,二是ONT纳米孔测序。其中,PacBio平台基于SMRT技术,测序时DNA不需要经过PCR扩增,实现了对每一条DNA分子的单独测序,读长可达30kb-100kb,且具有高准确度、无GC偏好性和单分子分辨率的特点,更适合用于遗传病基因检测。

可以看出,三代测序长读长的特点突出,可达到二代测序的100倍以上。但是,其存在成本高、不准确等问题,限制了它的临床应用。

这些问题正在得到改善。关于准确率,PacBio三代测序错误率在10%-15%之间,但是错误是随机的,可以通过对单条DNA分子的滚环测序实现自我校正,达到高准确性。还可以通过同一条分子的多拷贝并行CCS测序进一步校正。测序40次的时候,校正后的准确度可达99.999%,超过二代测序的99%。

“我们现在单次成像的准确度确实只有近90%,但每次10%的出错概率是随机的。这意味着,可以通过多次测序去校正它,不可能每次都在同一个地方出错。所以校正之后的准确度是非常高的。”贝瑞基因三代测序事业部总监任志林说。

关于成本,三代测序为每100万个碱基0.33-1.00美元,高于二代测序六倍以上。但是可以选择仅针对目标单病区域进行检测来降低成本,地贫就是一个很好的例子。并且,产品一旦在临床进行大规模应用,可以提高通量、降低成本。

任志林表示:“好的东西它应该有一个匹配价值的价格,确实我们现在如果做三代的全基因组测序,绝对成本是二代的4-5倍,意味着可能要几万块钱一个样本。但是我们可以不测全基因组,就测一个基因,这样会节省很多测序成本。同时我们努力在临床上去开发大规模应用,每年可以做几十万、几百万的样本的时候,成本会大大降低,甚至会接近二代测序的成本。”

而在技术发展的背景下,三代测序的成本也将持续下降。据方舟投资(ARK Invest)年初预测,到2025年底,三代测序对整个人类基因组测序的成本将下降到100-200美元,和二代测序几乎实现成本平价。同时,三代测序所带来的营收或将以每年82%的速度增长,从2020年的2.5亿美元增长到2025年的50亿美元左右。

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图片来源:Pacific Biosciences三代测序仪

目前,贝瑞基因是三代测序仪厂商Pacific Biosciences国内唯一的临床应用合作伙伴,也是其全球最大的合作伙伴。

地贫防治潜在市场巨大

试水三代测序,地贫绝对是一个绝佳切入点。

地贫即地中海贫血(Thalassemia),属于罕见病之一,中国南方是高发地区,目前临床上尚无经济有效的治疗手段,很多家庭因病致贫、因病返贫。

一方面,地贫筛查具有巨大的潜在市场。据国海证券研报数据,地贫是世界上发病率最高、危害性最大的单基因遗传学疾病之一。在我国每年2000多万的出生人口中,患地贫的新生儿有150多万,发病率为 7.8%,我国南方地区为高发区域人群携带率高达24%。其发病是由于珠蛋白基因的缺失或点突变,分为α型、β型、δβ型和δ型 4 种。目前,中国的地贫基因的筛查渗透率低仅有10%,拓展空间较大。

另一方面,地贫的支付方相对明确,可以由政府买单。地贫预防主要通过三级预防基因筛查,一级为婚检、二级为孕检、三级为地贫患儿确诊,婚检和孕检可避免地贫患儿的降生,地贫患儿确诊可以及早治疗,降低影响。广西、广东、海南、云南、贵州、重庆、江西、四川、福建、湖南是我国地贫高发区域,2018年,国家卫健委对这十省地贫防控工作提出了明确要求,深入开展地贫防控项目,加大检测力度。

并且,三代地贫产品的准确度与覆盖面均超出现有产品。据贝瑞基因2021年7月发表的三代地贫多中心临床前瞻性研究成果,三代地贫检测准确性为100%。同时还具有传统PCR检测范围外的性能提升,可以实现地贫基因变异的额外检出。相较于传统PCR、NGS、MLPA等联合应用,三代地贫可将罕见型α地贫和β地贫的基因诊断率分别提升约40%和60%。

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图片来源:三代地贫与传统检测方法数据对比

任志林告诉本报记者:“由于各省情况和物价标准不同,我们三代地贫的终端定价会根据当地的实际情况定出一个合理的价格,与现有传统检测方法价格相差不大。我们也会推出一些高端产品,进行罕见型地贫的检测,因为要花更多的人力来解读,这方面收费会高一点。”

而由于主营业务是无创产筛,贝瑞基因积累了大量妇幼领域的渠道资源,这与三代地贫业务具有较高重合度。高扬表示,业内的核心专家,对贝瑞基因这个品牌与产品的质量性能有信任感,所以推广相对会容易一些。

“但是话又说回来,在出生缺陷防控很细分的领域里面,特别讲究产品性能,证伪非常容易,如果这个产品本身质量不够硬的话,再好的渠道再好的平台做不起来。所以我们的品牌与渠道只是一个加分项,关键还是要靠过硬的产品性能。”高扬说。

一直以来,贝瑞基因的主营业务是无创产筛,占据国内大部分市场份额,但受到疫情冲击,以及出生人口下降影响,其业绩有所回落。而三代地贫产品的落地将为其带来新的业绩增长点,目前其已与南方地贫高发的十省的多家权威产前诊断中心达成合作,进行三代地贫基因检测。

除了政府支付,自费端也有较大增长空间。“以我们在广西的调研结果为例,政府买单的检测实际上只占整个地贫基因检测的一小部分。”任志林说。

并且,后续基于三代测序平台,会有更多的产品问世,在遗传病筛查领域,据高扬透露,有望进行产品的拓展与打包,即选择中国人群范围内携带率比较高的几种隐性遗传病基因检测进行整合。比如,贝瑞基因最新研发的三代CAH(先天性肾上腺皮质增生症)新产品也即将上市。而在肿瘤领域,可以想象的空间也非常大。

“相信作为三代测序在临床应用场景的突破口之一,三代地贫只是一个开始,未来三代测序仪在探寻基因疾病以及人类全基因数据读取方面的应用,将有巨大的潜力和广阔的应用空间。”高扬表示。

责任编辑:方凤娇 主编:陈岩鹏

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